Микробиология, Биология прокариотов, Том 3, Пиневич А.В., 2009

Микробиология, Биология прокариотов, Том 3, Пиневич А.В., 2009.
 Фундаментальный учебник по микробиологии, впервые издаваемый в С.-Петербурге, основан на курсах лекций, которые автор читает студентам Биолого-почвенного факультета Университета с начала 1970-х годов. Наряду с классическими сведениями излагаются современные представления о биологии бактерий и архей. Многие вопросы рассматриваются под непривычным углом зрения, а некоторые еще не обсуждались в отечественной литературе. Учебник отражает гигантский прогресс в изучении структурно-функциональной организации, биоразнообразия и филогении прокариотов. Одним читателям это расширит кругозор, другим поможет переосмыслить представления об организации прокариотов, их роли в органической эволюции и биосфере. Последний, III том посвящен цитогенетике, онтогенезу, регуляции, экологическим стрессам, синэкологии, микробным культурам и биотехнологии. Учебник рекомендуется студентам, аспирантам биологических факультетов университетов, может быть полезен исследователям-микробиологам, а также специалистам в других естественных науках.

ЦИТОГЕНЕТИКА.
Цитогенетику часто определяют как раздел общей генетики, в котором явления наследственности и изменчивости рассматриваются на клеточном и субклеточном уровнях. Встречаются и развернутые определения данного предмета. Например, во введении к одноименному вузовскому учебнику сказано: «Цитогенетикой можно назвать науку, изучающую особенности воспроизведения, рекомбинации, изменения и функционирования генетически значимых структур клетки, их распределение в митозе, мейозе и при оплодотворении в зависимости от их числа и генетического строения» (В. Г. Смирнов, 1991).
Таким образом, объектом цитогенетики в ее традиционном понимании выступают цитологические и генетические свойства ядерных хромосом, а также, в меньшей степени, хромосом симбиотических органелл (митохондрий и пластид). В то же время молекулярно-информационные аспекты наследственности и изменчивости, т. е. полиморфизм генома, его размер и инфраструктура, консерватизм и непостоянство, а также эволюция отданы на рассмотрение другой дисциплине — геномике.
ОГЛАВЛЕНИЕ
Предисловие
ГЛАВА 16. Цитогенетика
16.1. Репликоны
16.1.1. Хромосомы
16.1.2. Плазмиды
16.1.2.1. Классификация плазмид
16.1.2.2. Строение плазмид
16.1.2.3. Природное и практическое значение плазмид
16.2. Размер генома
16.3. Инфраструктура генома
16.3.1. Кодирующие участки
16.3.1.1. Гены
16.3.1.2. Опероны
16.3.1.3. Мобильные элементы
16.3.1.4. Интроны
16.3.2. Некодирующие участки
16.3.2.1. Повторяющиеся последовательности
16.3.2.2. Внутренние транскрибируемые спейсеры
16.4. Самовоспроизведение генома
16.4.1. Репликация
16.4.1.1. Репликация хромосом
16.4.1.2. Репликация плазмид
16.4.2. Взаимная изоляция сестринских репликонов
16.4.2.1. Расхождение сестринских хромосом
16.4.2.2. Расхождение сестринских плазмид
16.5. Консерватизм генома
16.5.1. Репарация
16.5.1.1. Фотореактивация
16.5.1.2. Эксцизионная репарация
16.5.1.3. Репарация ошибок спаривания
16.5.1.4. Рекомбинационная репарация
16.5.2. Рестрикция и модификация
16.6. Изменения генома
16.6.1. Наследственные изменения
16.6.1.1. Мутации
16.6.1.2. Рекомбинация
16.6.1.3. Горизонтальный перенос генов
16.6.2. Ненаследуемые изменения
16.6.3. Эволюция прокариотных геномов
16.7. Экспрессия генома
16.7.1. Транскрипция
16.7.1.1. Инициация транскрипции
16.7.1.2. Элонгация
16.7.1.3. Терминация
16.7.2. Обратная транскрипция
16.7.3. Транскрипция у архей
16.7.4. Посттранскрипционный процессинг мРНК
16.7.5. Деградация мРНК
16.8.    Эпигенетическое наследование
ГЛАВА 17. Онтогенез
17.1. Клеточный цикл
17.1.1. Структура клеточного цикла
17.1.2. Регуляция клеточного цикла
17.1.3. Циркадные ритмы и их связь с клеточным циклом
17.1.4. Клеточный цикл и клеточное развитие
17.1.5. Особенности клеточного цикла у архей
17.2. Старение и смерть клетки
17.2.1. Старение клетки
17.2.2. Смерть клетки
17.3. Клеточный рост
17.3.1. Рост палочковидных и сферических клеток
17.3.2. Полярный рост и поляризация клетки
17.4. Клеточное деление
17.4.1. Выбор сайта деления
17.4.2. Кольцо деления
17.4.3. Самосборка дивисомы
17.4.4. Финал деления
17.4.5. Деление митохондрий и пластид
17.4.6. Деление архей
17.5. Клеточная дифференциация
17.5.1. Метаболически активные дифференцированные клетки
17.5.1.1. Агенты распространения — беоциты и гормогонии
17.5.1.2. Фабрики диазотрофии — диазоциты и гетероцисты цианобактерий, бактероиды ризобиев и везикулы актинобактерий
17.5.2. Покоящиеся резистентные клетки
17.5.2.1. Цисты
17.5.2.2. Эндоспоры
ГЛАВА 18. Регуляция
18.1. Регуляция транскрипции
18.1.1. Регуляторы транскрипции
18.1.1.1. Сигма-факторы
18.1.1.2. Антисигма-факторы и анти-антисигма-факторы
18.1.1.3. Транскрипционные факторы
18.1.2. Регулоны
18.1.3. Стимулоны
18.1.4. Модулоны
18.2. Посттранскрипционная регуляция
18.2.1. Регуляторные белки
18.2.2. Регуляторные РНК
18.3. Регуляция метаболизма
18.3.1. Регуляция энергетического метаболизма
18.3.1.1. Регуляция фототрофии
18.3.1.2. Регуляция хемотрофии
18.3.2. Регуляция конструктивного метаболизма
18.3.2.1. Регуляция синтеза рРНК
18.3.2.2. Регуляция углеродного метаболизма
18.3.2.3. Регуляция азотного метаболизма
18.3.2.4. Регуляция фосфорного метаболизма
18.3.2.5. Регуляция железного метаболизма
18.3.3. Регуляция вторичного метаболизма
18.4. Регуляция поведения
18.4.1.    Индивидуальное поведение и таксисы
18.4.1.1. Таксис, не зависящий от метаболизма: хемотаксис
18.4.1.2. Таксис, не зависящий от метаболизма: фототаксис
18.4.1.3. Таксис, зависящий от метаболизма: энерготаксис
18.4.1.4. Таксис, зависящий от транспорта
18.4.1.5. Другие формы таксисов
18.4.2.    Коллективное поведение на основе внутрипопуляционной коммуникации
ГЛАВА 19. Экологические стрессы
19.1. Цитоплазматические стрессы
19.1.1. Термические стрессы
19.1.2. Водный стресс
19.1.3. Осмотический шок
19.1.4. Гидростатический стресс
19.1.5. Радиационный стресс
19.1.6. Окислительный стресс
19.1.6.1. Механизм окислительного стресса
19.1.6.2. Защитный ответ при окислительном стрессе
19.1.7. pH-стресс
19.1.8. Токсический стресс
19.2. Периплазматический стресс
ГЛАВА 20. Синэкология
20.1. Эпибиоз
20.1.1. Микробные маты
20.1.2. Консорции
20.2. Квази-эндоцитобиоз
20.3. Эндоцитобиоз
20.3.1. Эндоцитобиоз на основе фотосинтеза
20.3.2. Эндоцитобиоз на основе хемосинтеза
20.3.3. Эндоцитобиоз на основе диазотрофии
20.3.4. Эндоцитобиоз на основе хемогетеротрофии
20.3.4.1. Эндоцитобиоз у протистов
20.3.4.2. Эндоцитобиоз у беспозвоночных
20.3.5. Внутриклеточный паразитизм зоопатогенных бактерий
20.4. Ксеносомы
20.4.1. Фототрофные ксеносомы
20.4.1.1. Цианеллы
20.4.1.2. Собственно пластиды
20.4.2. Хемотрофные ксеносомы
20.5. Эктобиоз
20.5.1. Эктобиоз бактерий с животными
20.5.2. Эктобиоз бактерий с растениями
20.6. Эндобиоз
20.6.1. Эндобиоз бактерий с животными
20.6.2. Эндобиоз бактерий с растениями
ГЛАВА 21. Микробные культуры и биотехнология
21.1. Микробные культуры
21.1.1. Закономерности периодической культуры
21.1.2. Закономерности непрерывной культуры
21.2. Биотехнология
21.2.1. Продуценты
21.2.2. Сырье и ферментеры
21.2.3. Продукты биотехнологии
Заключение
Предметный указатель.